Current Biotechnology ›› 2022, Vol. 12 ›› Issue (4): 606-613.DOI: 10.19586/j.2095-2341.2021.0184
• Articles • Previous Articles Next Articles
Peixuan MEN(
), Yufeng XIAO, Bin ZHANG(
)
Received:2021-11-16
Accepted:2021-12-21
Online:2022-07-25
Published:2022-08-10
Contact:
Bin ZHANG
通讯作者:
张玢
作者简介:门佩璇 E-mail:men.peixuan@imicams.ac.cn;
基金资助:CLC Number:
Peixuan MEN, Yufeng XIAO, Bin ZHANG. Analysis of Clinical Application and Technology Hotspots of Digital PCR Technology Based on Bibliometrics Methods[J]. Current Biotechnology, 2022, 12(4): 606-613.
门佩璇, 肖宇锋, 张玢. 基于计量学方法分析数字PCR技术的临床应用现状与技术热点[J]. 生物技术进展, 2022, 12(4): 606-613.
| 检测对象 | 临床应用 |
|---|---|
| 循环肿瘤ctDNA | 非侵入性检测非小细胞肺癌、前列腺癌、乳腺癌、头颈部鳞状细胞癌的基因突变 |
| 肿瘤标本的等位基因绝对定量、罕见突变检测、拷贝数变异分析、DNA甲基化和基因重排等 | |
| 指导肺腺癌EGFR⁃TKI个性化治疗 | |
| 胎儿游离DNA | 诊断胎儿染色体非整体疾病 |
| 检测甲基丙二酸血症、血友病突变基因等单基因遗传病 | |
| 病原微生物核酸 | 检测HIV、新冠肺炎病毒等病原体鉴定 |
| 检测HBV、结核分枝杆菌等耐药突变 | |
| 检测青光眼睫状体炎综合征患者房水的人巨细胞病毒 | |
| 供体来源游离DNA | 非侵入性检测移植后的排斥反应 |
Table 1 Main clinical application fields of dPCR[6]
| 检测对象 | 临床应用 |
|---|---|
| 循环肿瘤ctDNA | 非侵入性检测非小细胞肺癌、前列腺癌、乳腺癌、头颈部鳞状细胞癌的基因突变 |
| 肿瘤标本的等位基因绝对定量、罕见突变检测、拷贝数变异分析、DNA甲基化和基因重排等 | |
| 指导肺腺癌EGFR⁃TKI个性化治疗 | |
| 胎儿游离DNA | 诊断胎儿染色体非整体疾病 |
| 检测甲基丙二酸血症、血友病突变基因等单基因遗传病 | |
| 病原微生物核酸 | 检测HIV、新冠肺炎病毒等病原体鉴定 |
| 检测HBV、结核分枝杆菌等耐药突变 | |
| 检测青光眼睫状体炎综合征患者房水的人巨细胞病毒 | |
| 供体来源游离DNA | 非侵入性检测移植后的排斥反应 |
| 序号 | 机构名称 | 所属国家 | 文献数 |
|---|---|---|---|
| 1 | 弗雷德-哈钦森肿瘤研究中心 | 美国 | 31 |
| 2 | 哈佛医学院丹娜法伯癌症研究所 | 美国 | 25 |
| 3 | Bio⁃Rad公司 | 美国 | 18 |
| 3 | 清华大学 | 中国 | 17 |
| 4 | 奥胡斯大学 | 丹麦 | 17 |
| 5 | 九州大学 | 日本 | 14 |
| 6 | 法国国家健康与医学研究院 | 法国 | 8 |
| 7 | 近畿大学 | 日本 | 7 |
| 8 | 筑波大学 | 日本 | 7 |
| 9 | 布朗大学阿尔伯特医学院 | 美国 | 7 |
Table 2 Main institutions of publishing English articles on dPCR technology(Top 10)
| 序号 | 机构名称 | 所属国家 | 文献数 |
|---|---|---|---|
| 1 | 弗雷德-哈钦森肿瘤研究中心 | 美国 | 31 |
| 2 | 哈佛医学院丹娜法伯癌症研究所 | 美国 | 25 |
| 3 | Bio⁃Rad公司 | 美国 | 18 |
| 3 | 清华大学 | 中国 | 17 |
| 4 | 奥胡斯大学 | 丹麦 | 17 |
| 5 | 九州大学 | 日本 | 14 |
| 6 | 法国国家健康与医学研究院 | 法国 | 8 |
| 7 | 近畿大学 | 日本 | 7 |
| 8 | 筑波大学 | 日本 | 7 |
| 9 | 布朗大学阿尔伯特医学院 | 美国 | 7 |
| 序号 | 申请人 | 专利数量 |
|---|---|---|
| 1 | 领航基因科技(杭州)有限公司 | 21 |
| 2 | 宁波胤瑞生物医学仪器有限责任公司 | 12 |
| 3 | 广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 12 |
| 4 | 新羿制造科技(北京)有限公司 | 12 |
| 5 | 上海赛安生物医药科技股份有限公司 | 11 |
| 6 | 中国检验检疫科学研究院 | 11 |
| 7 | 上海新微技术研发中心有限公司 | 10 |
| 8 | 北京致雨生物科技有限公司 | 10 |
| 9 | 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 | 8 |
| 10 | Bio⁃Rad生命医学产品公司 | 7 |
| 11 | 加州理工学院 | 7 |
| 12 | 利兰斯坦福初级大学董事 | 7 |
| 13 | 中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 7 |
| 14 | 中山大学达安基因股份有限公司 | 7 |
| 15 | 北京爱普拜生物技术有限公司 | 7 |
| 16 | 暨南大学 | 7 |
| 17 | 美国生命技术公司 | 6 |
| 18 | 中国科学院上海微系统与信息技术研究所 | 6 |
| 19 | 浙江省农业科学院 | 6 |
| 20 | 良培基因生物科技(武汉)有限公司 | 6 |
Table 3 Main patent applicants of dPCR technology(Top 20) at home and aloroad
| 序号 | 申请人 | 专利数量 |
|---|---|---|
| 1 | 领航基因科技(杭州)有限公司 | 21 |
| 2 | 宁波胤瑞生物医学仪器有限责任公司 | 12 |
| 3 | 广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 12 |
| 4 | 新羿制造科技(北京)有限公司 | 12 |
| 5 | 上海赛安生物医药科技股份有限公司 | 11 |
| 6 | 中国检验检疫科学研究院 | 11 |
| 7 | 上海新微技术研发中心有限公司 | 10 |
| 8 | 北京致雨生物科技有限公司 | 10 |
| 9 | 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 | 8 |
| 10 | Bio⁃Rad生命医学产品公司 | 7 |
| 11 | 加州理工学院 | 7 |
| 12 | 利兰斯坦福初级大学董事 | 7 |
| 13 | 中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 7 |
| 14 | 中山大学达安基因股份有限公司 | 7 |
| 15 | 北京爱普拜生物技术有限公司 | 7 |
| 16 | 暨南大学 | 7 |
| 17 | 美国生命技术公司 | 6 |
| 18 | 中国科学院上海微系统与信息技术研究所 | 6 |
| 19 | 浙江省农业科学院 | 6 |
| 20 | 良培基因生物科技(武汉)有限公司 | 6 |
| 1 | 田星,张春玉.数字PCR技术概述[J].国际遗传学杂志,2017,40(3):141-144. |
| 2 | SYKES P J, NEOH S H, BRISCO M J, et al.. Quantitation of targets for PCR by use of limiting dilution[J]. Biotechniques, 1992, 13(3): 444-449. |
| 3 | VOGELSTEIN B, KINZLER K W. Digital PCR[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1999, 96(16): 9236-9241. |
| 4 | LIU J, HANSEN C, QUAKE S R. Solving the "world-to-chip" interface problem with a microfluidic matrix[J]. Anal. Chem., 2003, 75(18): 4718-4723. |
| 5 | 黄瑾,梁涛波,许恒毅.数字PCR在生物学检测中应用的研究进展[J].生命科学,2021,33(2):255-264. |
| 6 | 杨德平,刘维薇.数字PCR技术在临床诊断中的应用进展[J].临床检验杂志,2016,34(10):785-787. |
| 7 | The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University. Nicht-invasives fötales genetisches screening mittels digitaler analyse USA:EP15195663[P]. 2019-05-08. |
| 8 | 赵蕴华,袁芳,傅俊英,等.基于专利分析的肿瘤基因PCR诊断技术研究[J].现代生物医学进展,2020,20(1):181-186. |
| 9 | 祁恒,王立东,刘瑞东,等.PCR微流控芯片技术专利分析[J].中国发明与专利,2020,17(11):72-77. |
| 10 | 腾讯网.第三代PCR: 数字PCR技术、应用、市场发展梳理[EB/OL].(2021-07-23)[2021-12-21]. . |
| 11 | TANAKA T, KOBUNAI T, YAMAMOTO Y, et al.. Increased copy number variation of mtDNA in an array-based digital PCR assay predicts ulcerative colitis-associated colorectal cancer[J]. IN VIVO, 2017, 31: 713-718. |
| 12 | SACHER A G, PAWELETZ C, DAHLBERG S E, et al.. Prospective validation of rapid plasma genotyping for the detection of EGFR and KRAS mutations in advanced lung cancer[J]. JAMA Oncol., 2016, 2(8): 1014-1022. |
| 13 | GINKEL J H V, MANON M H H, ES R J J V, et al.. Droplet digital PCR for detection and quantification of circulating tumor DNA in plasma of head and neck cancer patients[J/OL]. BMC Cancer, 2017, 17(1): 428[2022-03-04]. . |
| 14 | CONTEDUCA V, WETTERSKOG D, SHARABIANI M T A, et al.. Androgen receptor gene status in plasma DNA associates with worse outcome on enzalutamide or abiraterone for castration-resistant prostate cancer: a multi-institution correlative biomarker study[J]. Ann. Oncol., 2017, 28(7): 1508-1516. |
| 15 | 毛旭华,汤俊明,马芬芬,等.微滴式数字PCR技术检测非小细胞肺癌患者外周血EGFR基因突变[J].临床检验杂志,2018,36(8):589-592. |
| 16 | WANG Z, CHENG Y, AN T, et al.. Detection of EGFR mutations in plasma circulating tumour DNA as a selection criterion for first-line gefitinib treatment in patients with advanced lung adenocarcinoma(BENEFIT): a phase 2, single-arm, multicentre clinical trial [J/OL]. Lancet. Respir Med., 2018, 6(9): 681-690. |
| 17 | YU F T, YAN L T, WANG N, et al.. Quantitative detection and viral load analysis of SARS-CoV-2 in infected patients[J]. Clin. Infect. Dis., 2020, 71(15): 793-798. |
| 18 | CHEN H L, WU R, XING Y, et al.. Influence of different inactivation methods on severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 RNA copy number[J/OL]. J. Clin. Microbiol., 2020, 58(8): e00958-20[2022-03-04]. . |
| 19 | KASTEREN P B, VEER B D, BRINK S D, et al.. Comparison of seven commercial RT-PCR diagnostic kits for COVID-19[J/OL]. J. Clin. Virol., 2020, 128: 104412[2022-03-04]. . |
| 20 | LIU Y, NING Z, CHEN Y, et al.. Aerodynamic analysis of SARS-CoV-2 in two Wuhan hospitals[J/OL]. Nature, 2020, 582(7813): 557[2022-03-04]. . |
| 21 | WONG Y C, LAU S Y, TO K K W, et al.. Natural Transmission of Bat-like severe acute respiratory syndrome Coronavirus 2 without proline-arginine-arginine-alanine variants in Coronavirus disease 2019 patients[J/OL]. Clin. Infect. Dis., 2021, 73(2): E437-E444[2022-03-04]. . |
| 22 | ZHU Z, LU Z H, XU T M, et al.. Arbidol monotherapy is superior to lopinavir/ritonavir in treating COVID-19[J/OL]. J. Infect., 2020, 81(1): E21-E23[2022-03-04]. . |
| 23 | LEE S Y, KIM S J, HAN S H, et al.. A new approach of digital PCR system for non-invasive prenatal screening of trisomy 21[J]. Clin. Chim. Acta, 2018, 476: 75-80. |
| 24 | TAN C, CHEN X, WANG F, et al.. A multiplex droplet digital PCR assay for non-invasive prenatal testing of fetal aneuploidies[J]. Analyst, 2019, 144(7): 2239-2247. |
| 25 | BECK J, BIERAU S, BALSER S, et al.. Digital droplet PCR for rapid quantification of donor DNA in the circulation of transplant recipients as a potential universal biomarker of graft injury[J]. Clin. Chem., 2013, 59(12): 1732-1741. |
| 26 | KOJABAD A A, FARZANEHPOUR M, GALEH H E G, et al.. Droplet digital PCR of viral DNA/RNA, current progress, challenges, and future perspectives[J]. J. Med. Virol., 2021, 93(7): 4182-4197. |
| 27 | LEI S, CHEN S, ZHONG Q. Digital PCR for accurate quantification of pathogens: principles, applications, challenges and future prospects[J]. Int. J. Biol. Macromol., 2021, 184(4): 750-759. |
| [1] | Yanyan JIA, Luyang DUANMU. Study on the Mechanism of Bubble Generation and Inhibition Method During Digital PCR Amplification Process [J]. Current Biotechnology, 2025, 15(4): 693-701. |
| [2] | Xin QI, Xinran LI, Yaning GUO, Dan WANG, Kai LI, Qiong WU, Liang LI. Comparison of Endogenous Genes in Maize Based on Digital PCR [J]. Current Biotechnology, 2025, 15(1): 78-85. |
| [3] | Hongbo FAN, Liangyong HU, Songqing HU. Establishment of Digital PCR Detection System for Helicobacter pyloriureC and 23S rDNA [J]. Current Biotechnology, 2024, 14(5): 868-874. |
| [4] | Yaping HU, Zhenghong YU. Current Status of Research on mRNA Vaccines Against Viral Infectious Diseases [J]. Current Biotechnology, 2024, 14(4): 566-575. |
| [5] | Dongfeng CHANG, Zhaopeng SUN. Structure and Clinical Application of mRNA Drugs [J]. Current Biotechnology, 2024, 14(1): 1-16. |
| [6] | Yi JI, Kaili WANG, Huiru YU, Xin ZHAO, Lin DING, Cheng PENG, Junfeng XU, Xiaoyun CHEN. Development of Sheep-derived Genomic DNA Reference Material [J]. Current Biotechnology, 2024, 14(1): 125-132. |
| [7] | LU Haiqiang1, JIAO Xinya1,2, WU Siyuan2, WANG Yali2, LIU Lu2, CHENG Shumei1, ZHANG Xiao3*, SU Xiaofeng2*. Application Progress on the Digital PCR in Detection of Foodborne Pathogenic Bacteria [J]. Curr. Biotech., 2021, 11(3): 260-268. |
| [8] | WANG Di, WU Xiao, WANG Zhidong, GAO Yunhua*. Research Progress on the Flow Cytometry Counting for Single Nucleotide Molecule [J]. Curr. Biotech., 2020, 10(6): 573-578. |
| [9] | ZHENG Zifan, LIU Fangfang, LIU Weixiao, JIN Wujun, LI Liang*. Application of Digital PCR Technology in the Development of Nucleic Acid Reference Materials [J]. Curr. Biotech., 2020, 10(6): 579-584. |
| [10] | WANG Shangjun1, DONG Lianhua2. Research on Calibration Method of Digital PCR Instrument [J]. Curr. Biotech., 2020, 10(6): 585-589. |
| [11] | HU Sihong, YOU Guoye. Application Prospects of Digital PCR in Detection of SARS-CoV-2 [J]. Curr. Biotech., 2020, 10(6): 674-679. |
| [12] | JI Yi, CHEN Xiaoyun, DING Lin, WANG Xiaofu, PENG Cheng, XU Xiaoli, XU Junfeng*. Progress on Identification Methods of Animal-derived Ingredients in Meat and Meat Products [J]. Curr. Biotech., 2020, 10(6): 711-716. |
| [13] | LIU Xiao1, ZHU Pengyu2, JING Xiaoyan2, LI Zhihong1, ZHANG Yongjiang2, LI Xiang3, FU Wei1,2*. Application of Duplex Droplet Digital PCR for Detection of Genetically Modified Soybean [J]. Curr. Biotech., 2020, 10(1): 60-66. |
| [14] | XUN Zhiming, ZHAO Qinghui, JU Fangdi, HE Jin, YAO Tingting, ZHAO Pengxiang, MA Xuemei, XIE Fei*. Progress on Hydrogen Molecule in Clinical Application [J]. Curr. Biotech., 2019, 9(3): 217-222. |
| [15] | HE Jie, GUO Caiping*. Progress on Purification and Clinical Applications of Human Transferrin [J]. Curr. Biotech., 2019, 9(1): 28-34. |
| Viewed | ||||||
|
Full text |
|
|||||
|
Abstract |
|
|||||