基于16S rRNA基因文库技术分析水性涂料菌群的多样性

doi:10.3969/j.issn.2095-2341.2016.04.13

生物技术进展 ›› 2016, Vol. 6 ›› Issue (4): 295-298.DOI: 10.3969/j.issn.2095-2341.2016.04.13

基于16S rRNA基因文库技术分析水性涂料菌群的多样性

黄小茉1,2,陶宏兵1,邱晓颖2,李良秋1,施庆珊1

1.广东省微生物研究所, 华南应用微生物国家重点实验室; 广东省菌种保藏与应用重点实验室, 广州 510070;

2.广东迪美生物技术有限公司, 广州 510663

收稿日期:2016-04-29 出版日期:2016-07-25 发布日期:2016-06-22
作者简介:黄小茉，高级工程师，研究方向为工业产品微生物危害防治。Tel：020-87137503;E-mail：molyhuang@21cn.com
基金资助:
广东省科技计划项目（2013B090600148; 2013B050800023）;揭阳市产学研结合项目(201429)资助。

Analysis of Waterborne Coating Bacterial Diversity by the 16S rRNA Gene Library

HUANG Xiao-mo, TAO Hong-bing, QIU Xiao-ying, LI Liang-qiu, SHI Qing-shan

1.State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China; Guangdong Provincial Key Laboratory of

Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou 510070, China;

2.Guangdong Demay Biological Technology Co., Ltd, Guangzhou 510663, China

Received:2016-04-29 Online:2016-07-25 Published:2016-06-22

摘要/Abstract

摘要： 采用未培养技术直接提取变质涂料微生物总DNA，使用通用引物进行PCR扩增、纯化、连接、克隆和测序，建立16S rRNA基因文库，分析变质水性涂料细菌的数量与种类。从96个克隆子中共检测到8种不同种属的细菌，假单胞菌属(Pseudomonas)为优势菌群，占总数的75%，软骨酸芽孢杆菌(Paenibacillus chondroitinus)占总数的15%，此外豚鼠气单胞菌(Aeromonas caviae)和粪产碱杆菌(Alcaligenes faecalis)分别占总数2%。结果表明16S rRNA基因文库是一种较好的研究水性涂料细菌群落多样性的方法。

关键词: 水性涂料, 16S rRNA, 细菌, 多样性

Abstract: Total microbial DNA was directly extracted from a metamorphic waterborne coating, the clone library of 16S ribosomal RNA genes was amplified using PCR with universal bacterial primer sets. The PCR products were then subcloned into pGEM-T vector, amplified DNA was used for diversity analysis. The total of 96 clones were selected and 8 kinds of microbe which were used for sequencing. Pseudomonas was the most one (75% of total clones), then was Paenibacillus chondroitinus (15% of total clones), Aeromonas caviae and Alcaligenes faecalis accounted for 2% of total clones respectively. 16S rRNA gene library is a good research method for waterborne bacteria community diversity analysis.

Key words: waterborne coating, 16S rRNA, bacterial, diversity

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基于16S rRNA基因文库技术分析水性涂料菌群的多样性

Analysis of Waterborne Coating Bacterial Diversity by the 16S rRNA Gene Library

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